リケラボ論文検索は、全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索できる論文検索サービスです。

リケラボ 全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索するならリケラボ論文検索大学・研究所にある論文を検索できる

リケラボ 全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索するならリケラボ論文検索大学・研究所にある論文を検索できる

大学・研究所にある論文を検索できる 「Draft Genome Sequence of the Polychlorinated Biphenyl Degrader Comamonas testosteroni Strain YAZ2, Isolated from a Natural Landscape in the Tohoku Region of Japan」の論文概要。リケラボ論文検索は、全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索できる論文検索サービスです。

コピーが完了しました

URLをコピーしました

論文の公開元へ論文の公開元へ
書き出し

Draft Genome Sequence of the Polychlorinated Biphenyl Degrader Comamonas testosteroni Strain YAZ2, Isolated from a Natural Landscape in the Tohoku Region of Japan

Hara, Tomijiro Takatsuka, Yumiko Shiwa, Yuh Yokota, Kenji 京都大学 DOI:10.1128/mra.00806-21

2022.01.20

概要

We report a draft genome sequence of Comamonas testosteroni strain YAZ2, a polychlorinated biphenyl (PCB) degrader that was isolated from a PCB-unpolluted environment. The assembled genome contains a single 5.4-Mb chromosome and an 87-kb plasmid. The bph gene cluster, which is involved in PCB degradation, was found on the chromosome.

この論文で使われている画像

参考文献

Volume 11 Issue 1 e00806-21

Illumina sequence data. Bioinformatics 30:2114–2120. https://doi.org/10

.1093/bioinformatics/btu170.

5. Zerbino DR, Birney E. 2008. Velvet: algorithms for de novo short read assembly using de Bruijn graphs. Genome Res 18:821–829. https://doi.org/

10.1101/gr.074492.107.

6. Hara T, Takatsuka Y, Shiwa Y, Yokota K, Shin-i T. 2021. Manual recursive

mapping method for the draft genome sequence of Comamonas testosteroni strain YAZ2. figshare https://doi.org/10.6084/m9.figshare.17132309.v7.

7. Tanizawa Y, Fujisawa T, Nakamura Y. 2018. DFAST: a flexible prokaryotic

genome annotation pipeline for faster genome publication. Bioinformatics

34:1037–1039. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx713.

mra.asm.org 2

Downloaded from https://journals.asm.org/journal/mra on 04 July 2022 by 133.3.201.31.

1. Hara T, Takatsuka Y. Aerobic polychlorinated biphenyl-degrading bacteria

isolated from the Tohoku region of Japan are not regionally endemic. Can

J Microbiol, in press. https://doi.org/10.1139/cjm-2021-0056.

2. Kimbara K, Hashimoto T, Fukuda M, Koana T, Takagi M, Oishi M, Yano K.

1988. Isolation and characterisation of a mixed culture that degrades polychlorinated biphenyls. Agric Biol Chem 52:2885–2891. https://doi.org/10

.1080/00021369.1988.10869161.

3. Martin M. 2011. Cutadapt removes adapter sequences from high-throughput sequencing reads. EMBnet J 17:10–12. https://doi.org/10.14806/ej.17.1

.200.

4. Bolger AM, Lohse M, Usadel B. 2014. Trimmomatic: a flexible trimmer for

...

参考文献をもっと見る

全国の大学の
卒論・修論・学位論文

一発検索!

この論文の関連論文を見る