リケラボ論文検索は、全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索できる論文検索サービスです。

リケラボ 全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索するならリケラボ論文検索大学・研究所にある論文を検索できる

リケラボ 全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索するならリケラボ論文検索大学・研究所にある論文を検索できる

大学・研究所にある論文を検索できる 「プロテインキナーゼ指向性化合物ライブラリを基盤とした選択的阻害剤の創出」の論文概要。リケラボ論文検索は、全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索できる論文検索サービスです。

コピーが完了しました

URLをコピーしました

論文の公開元へ論文の公開元へ
書き出し

プロテインキナーゼ指向性化合物ライブラリを基盤とした選択的阻害剤の創出

入江 隆行 大阪府立大学 DOI:info:doi/10.24729/00017776

2022.07.21

概要

本研究では、キナーゼ一般に適用可能な、キナーゼ指向性化合物ライブラリを基盤とした選 択的阻害剤探索法を構築し、ヒットやリード化合物を簡便かつ迅速に見出すことを目的とする。

第1章では、基盤となるキナーゼ指向性化合物ライブラリの開発について述べる。キナーゼ 結合性フラグメントと多様性フラグメントをクリックケミストリーで簡便に連結させ、キナー ゼ阻害剤開発の出発点となるヒット化合物を生み出す Kinase Focused Evolved Fragment(KFEF) ライブラリを作成した。第2章では、高効率なキナーゼ結合性フラグメントである 7-アザイン ドールを基にしたリード探索法について述べる。KFEF ライブラリから見出した HGK キナーゼ のヒット化合物(7-アザインドール誘導体)から、7-アザインドールを足がかりにクリック合成 法で簡便に構造展開し、100 倍以上の活性増強や、異なる選択性プロファイルを有する誘導体を 迅速に見出した。第3章では、上述の KFEF ライブラリやリード探索法を活用して得た CDC7 キナーゼのリード化合物(7-アザインドール誘導体)の最適化研究について述べる。ADME の 課題を克服して経口投与可能な CDC7 選択的阻害薬 AS-0141 を創製した。

この論文で使われている画像

参考文献

1.6 参考文献

1) Cohen P., European Journal of Biochemistry, 268, 5001–5010 (2001).

2) Manning G., Whyte D. B., Martinez R., Hunter T., Sudarsanam S., Science, 298, 1912–1934 (2002).

3) Keri G., Orfi L., Eros D., Hegymegi-Barakonyi B., Szantai-Kis C., Horvath Z., Waczek F., Marosfalvi J., Szabadkai I., Pato J., Greff Z., Hafenbradl D., Daub H., Muller G., Klebl B., Ullrich A., Current Signal Transduction Therapy, 1, 67–95 (2006).

4) Hakoshima T., Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme, 51, 1557–1568 (2006).

5) Sawa M., Mini reviews in medicinal chemistry, 8, 1291–1297 (2008).

6) Schindler T., Bornmann W., Pellicena P., Miller W. T., Clarkson B., Kuriyan J., Science, 289, 1938–1942 (2000).

7) Attwood M. M., Fabbro D., Sokolov A. V., Knapp S., Schiöth H. B., Nat Rev Drug Discov, 1– 23 (2021).

8) Khan Z. M., Real A. M., Marsiglia W. M., Chow A., Duffy M. E., Yerabolu J. R., Scopton A. P., Dar A. C., Nature, 588, 509–514 (2020).

9) Zhang J., Adrián F. J., Jahnke W., Cowan-Jacob S. W., Li A. G., Iacob R. E., Sim T., Powers J., Dierks C., Sun F., Guo G.-R., Ding Q., Okram B., Choi Y., Wojciechowski A., Deng X., Liu G., Fendrich G., Strauss A., Vajpai N., Grzesiek S., Tuntland T., Liu Y., Bursulaya B., Azam M., Manley P. W., Engen J. R., Daley G. Q., Warmuth M., Gray N. S., Nature, 463, 501–506 (2010).

10) Kumar R., Crouthamel M.-C., Rominger D. H., Gontarek R. R., Tummino P. J., Levin R. A., King A. G., Brit J Cancer, 101, 1717–1723 (2009).

11) Izzedine H., Rixe O., Billemont B., Baumelou A., Deray G., Am J Kidney Dis, 50, 203–218 (2007).

12) 三宅 隆弘, 澤 匡明, “タンパク質結晶の最前線,” 2013.

13) Powers J. P., Li S., Jaen J. C., Liu J., Walker N. P. C., Wang Z., Wesche H., Bioorg Med Chem Lett, 16, 2842–2845 (2006).

14) Noronha G., Barrett K., Cao J., Dneprovskaia E., Fine R., Gong X., Gritzen C., Hood J., Kang X., Klebansky B., Li G., Liao W., Lohse D., Mak C. C., McPherson A., Palanki M. S. S., Pathak V. P., Renick J., Soll R., Splittgerber U., Wrasidlo W., Zeng B., Zhao N., Zhou Y., Bioorg Med Chem Lett, 16, 5546–5550 (2006).

15) Das J., Chen P., Norris D., Padmanabha R., Lin J., Moquin R. V., Shen Z., Cook L. S., Doweyko A. M., Pitt S., Pang S., Shen D. R., Fang Q., Fex H. F. de, McIntyre K. W., Shuster D. J., Gillooly K. M., Behnia K., Schieven G. L., Wityak J., Barrish J. C., Journal of Medicinal Chemistry, 49, 6819–6832 (2006).

16) Wood E. R., Truesdale A. T., McDonald O. B., Yuan D., Hassell A., Dickerson S. H., Ellis B., Pennisi C., Horne E., Lackey K., Alligood K. J., Rusnak D. W., Gilmer T. M., Shewchuk L., Cancer research, 64, 6652–6659 (2004).

2.5 参考文献

1) Bohacek R. S., McMartin C., Guida W. C., Med Res Rev, 16, 3–50 (1996).

2) Hann M. M., Leach A. R., Harper G., J Chem Inf Comp Sci, 41, 856–864 (2001).

3) Hajduk P. J., Sheppard G., Nettesheim D. G., Olejniczak E. T., Shuker S. B., Meadows R. P., Steinman D. H., Carrera G. M., Marcotte P. A., Severin J., Walter K., Smith H., Gubbins E., Simmer R., Holzman T. F., Morgan D. W., Davidsen S. K., Summers J. B., Fesik S. W., J Am Chem Soc, 119, 5818–5827 (1997).

4) Fejzo J., Lepre C. A., Peng J. W., Bemis G. W., Ajay, Murcko M. A., Moore J. M., Chem Biol, 6, 755–769 (1999).

5) Kolb H. C., Finn M. G., Sharpless K. B., Angewandte Chemie International Edition, 40, 2004– 2021 (2001).

6) Huisgen R., Angewandte Chemie Int Ed Engl, 2, 565–598 (1963).

7) Kolb H. C., Sharpless K. B., Drug discovery today, 8, 1128–1137 (2003).

8) Hein C. D., Liu X.-M., Wang D., Pharmaceut Res, 25, 2216–2230 (2008).

9) Lee L. V., Mitchell M. L., Huang S.-J., Fokin V. V., Sharpless K. B., Wong C.-H., J Am Chem Soc, 125, 9588–9589 (2003).

10) Chapman E., Ding S., Schultz P. G., Wong C.-H., J Am Chem Soc, 124, 14524–14525 (2002).

11) Sugawara A., Sunazuka T., Hirose T., Nagai K., Yamaguchi Y., Hanaki H., Sharpless K. B., Ōmura S., Bioorg Med Chem Lett, 17, 6340–6344 (2007).

12) Ghose A. K., Herbertz T., Pippin D. A., Salvino J. M., Mallamo J. P., Journal of Medicinal Chemistry, 51, 5149–5171 (2008).

13) Bissantz C., Kuhn B., Stahl M., J Med Chem, 53, 5061–5084 (2010).

14) Zhao H., Caflisch A., Bioorg Med Chem Lett, 25, 2372–2376 (2015).

15) Irwin J. J., Shoichet B. K., J Chem Inf Model, 45, 177–182 (2005).

16) Zhang L., Chen X., Xue P., Sun H. H. Y., Williams I. D., Sharpless K. B., Fokin V. V., Jia G., Journal of the American Chemical Society, 127, 15998–15999 (2005).

17) Tron G. C., Pirali T., Billington R. A., Canonico P. L., Sorba G., Genazzani A. A., Medicinal Research Reviews, 28, 278–308 (2008).

18) Graneto M. J., Kurumbail R. G., Vazquez M. L., Shieh H.-S., Pawlitz J. L., Williams J. M., Stallings W. C., Geng L., Naraian A. S., Koszyk F. J., Stealey M. A., Xu X. D., Weier R. M., Hanson G. J., Mourey R. J., Compton R. P., Mnich S. J., Anderson G. D., Monahan J. B., Devraj R., Journal of Medicinal Chemistry, 50, 5712–5719 (2007).

19) Pagliai F., Pirali T., Grosso E. D., Brisco R. D., Tron G. C., Sorba G., Genazzani A. A., Journal of Medicinal Chemistry, 49, 467–470 (2006).

20) Kiyoi H., Ohno R., Ueda R., Saito H., Naoe T., Oncogene, 21, 2555–2563 (2002).

21) Hooper C., Killick R., Lovestone S., Journal of neurochemistry, 104, 1433–1439 (2008).

22) Das J., Chen P., Norris D., Padmanabha R., Lin J., Moquin R. V., Shen Z., Cook L. S., Doweyko A. M., Pitt S., Pang S., Shen D. R., Fang Q., Fex H. F. de, McIntyre K. W., Shuster D. J., Gillooly K. M., Behnia K., Schieven G. L., Wityak J., Barrish J. C., Journal of Medicinal Chemistry, 49, 6819–6832 (2006).

23) Abad-Zapatero C., Metz J. T., Ligand efficiency indices as guideposts for drug discovery., 2005.

24) Tanaka D., Tsuda Y., Shiyama T., Nishimura T., Chiyo N., Tominaga Y., Sawada N., Mimoto T., Kusunose N., Journal of Medicinal Chemistry, 54, 851–857 (2011).

25) Orita M., Ohno K., Warizaya M., Amano Y., Niimi T., Methods in enzymology, 493, 383– 419 (2011).

26) Muhammad Z., Skagseth S., Boomgaren M., Akhter S., Fröhlich C., Ismael A., Christopeit T., Bayer A., Leiros H.-K. S., Bioorgan Med Chem, 28, 115598 (2020).

3.5 参考文献

1) Yao Z., Zhou G., Wang X. S., Brown A., Diener K., Gan H., Tan T.-H., J Biol Chem, 274, 2118–2125 (1999).

2) Wright J. H., Wang X., Manning G., LaMere B. J., Le P., Zhu S., Khatry D., Flanagan P. M., Buckley S. D., Whyte D. B., Howlett A. R., Bischoff J. R., Lipson K. E., Jallal B., Molecular and Cellular Biology, 23, 2068–2082 (2003).

3) Liang J. J., Wang H., Rashid A., Tan T.-H., Hwang R. F., Hamilton S. R., Abbruzzese J. L., Evans D. B., Wang H., Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research, 14, 7043–7049 (2008).

4) Graczyk P. P., J Med Chem, 50, 5773–5779 (2007).

5) Irie T., Sawa M., Chemical & pharmaceutical bulletin, 66, 29–36 (2018).

6) Ghose A. K., Herbertz T., Pippin D. A., Salvino J. M., Mallamo J. P., Journal of Medicinal Chemistry, 51, 5149–5171 (2008).

7) Tang J., Hamajima T., Nakano M., Sato H., Dickerson S. H., Lackey K. E., Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 18, 4610–4614 (2008).

8) Zhang C., Spevak W., Zhang Y., Burton E. A., Ma Y., Habets G., Zhang J., Lin J., Ewing T., Matusow B., Tsang G., Marimuthu A., Cho H., Wu G., Wang W., Fong D., Nguyen H., Shi S., Womack P., Nespi M., Shellooe R., Carias H., Powell B., Light E., Sanftner L., Walters J., Tsai J., West B. L., Visor G., Rezaei H., Lin P. S., Nolop K., Ibrahim P. N., Hirth P., Bollag G., Nature, 526, 583–586 (2015).

9) Farmer L. J., Ledeboer M. W., Hoock T., Arnost M. J., Bethiel R. S., Bennani Y. L., Black J. J., Brummel C. L., Chakilam A., Dorsch W. A., Fan B., Cochran J. E., Halas S., Harrington E. M., Hogan J. K., Howe D., Huang H., Jacobs D. H., Laitinen L. M., Liao S., Mahajan S., Marone V., Martinez-Botella G., McCarthy P., Messersmith D., Namchuk M., Oh L., Penney M. S., Pierce A. C., Raybuck S. A., Rugg A., Salituro F. G., Saxena K., Shannon D., Shlyakter D., Swenson L., Tian S.-K., Town C., Wang J., Wang T., Wannamaker M. W., Winquist R. J., Zuccola H. J., Journal of Medicinal Chemistry, 58, 7195–7216 (2015).

10) Wang X., Magnuson S., Pastor R., Fan E., Hu H., Tsui V., Deng W., Murray J., Steffek M., Wallweber H., Moffat J., Drummond J., Chan G., Harstad E., Ebens A. J., Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 23, 3149–3153 (2013).

11) Mérour J.-Y., Buron F., Plé K., Bonnet P., Routier S., Molecules (Basel, Switzerland), 19, 19935–19979 (2014).

12) Guimarães C. R. W., Rai B. K., Munchhof M. J., Liu S., Wang J., Bhattacharya S. K., Buckbinder L., Journal of chemical information and modeling, 51, 1199–1204 (2011).

13) Huang D., Zhou T., Lafleur K., Nevado C., Caflisch A., Bioinformatics, 26, 198–204 (2010).

4.5 参考文献

1) Masai H., Arai K.-I., Journal of cellular physiology, 190, 287–296 (2002).

2) Kim J. M., Kakusho N., Yamada M., Kanoh Y., Takemoto N., Masai H., Oncogene, 27, 3475– 3482 (2008).

3) Bonte D., Lindvall C., Liu H., Dykema K., Furge K., Weinreich M., Neoplasia (New York, N.Y.), 10, 920–931 (2008).

4) Rodriguez-Acebes S., Proctor I., Loddo M., Wollenschlaeger A., Rashid M., Falzon M., Prevost A. T., Sainsbury R., Stoeber K., Williams G. H., The American journal of pathology, 177, 2034–2045 (2010).

5) Montagnoli A., Tenca P., Sola F., Carpani D., Brotherton D., Albanese C., Santocanale C., Cancer research, 64, 7110–7116 (2004).

6) Sawa M., Masai H., Drug design, development and therapy, 2, 255–264 (2009).

7) Vanotti E., Amici R., Bargiotti A., Berthelsen J., Bosotti R., Ciavolella A., Cirla A., Cristiani C., D’Alessio R., Forte B., Isacchi A., Martina K., Menichincheri M., Molinari A., Montagnoli A., Orsini P., Pillan A., Roletto F., Scolaro A., Tibolla M., Valsasina B., Varasi M., Volpi D., Santocanale C., J Med Chem, 51, 487–501 (2008).

8) Menichincheri M., Albanese C., Alli C., Ballinari D., Bargiotti A., Caldarelli M., Ciavolella A., Cirla A., Colombo M., Colotta F., Croci V., D’Alessio R., D’Anello M., Ermoli A., Fiorentini F., Forte B., Galvani A., Giordano P., Isacchi A., Martina K., Molinari A., Moll J. K., Montagnoli A., Orsini P., Orzi F., Pesenti E., Pillan A., Roletto F., Scolaro A., Tatò M., Tibolla M., Valsasina B., Varasi M., Vianello P., Volpi D., Santocanale C., Vanotti E., J Med Chem, 53, 7296–7315 (2010).

9) Koltun E. S., Tsuhako A. L., Brown D. S., Aay N., Arcalas A., Chan V., Du H., Engst S., Ferguson K., Franzini M., Galan A., Holst C. R., Huang P., Kane B., Kim M. H., Li J., Markby D., Mohan M., Noson K., Plonowski A., Richards S. J., Robertson S., Shaw K., Stott G., Stout T. J., Young J., Yu P., Zaharia C. A., Zhang W., Zhou P., Nuss J. M., Xu W., Kearney P. C., Bioorg Med Chem Lett, 22, 3727–3731 (2012).

10) Ermoli A., Bargiotti A., Brasca M. G., Ciavolella A., Colombo N., Fachin G., Isacchi A., Menichincheri M., Molinari A., Montagnoli A., Pillan A., Rainoldi S., Sirtori F. R., Sola F., Thieffine S., Tibolla M., Valsasina B., Volpi D., Santocanale C., Vanotti E., Journal of Medicinal Chemistry, 52, 4380–4390 (2009).

11) Woods K. W., Lai C., Miyashiro J. M., Tong Y., Florjancic A. S., Han E. K., Soni N., Shi Y., Lasko L., Leverson J. D., Johnson E. F., Shoemaker A. R., Penning T. D., Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 22, 1940–1943 (2012).

12) Tong Y., Stewart K. D., Florjancic A. S., Harlan J. E., Merta P. J., Przytulinska M., Soni N., Swinger K. K., Zhu H., Johnson E. F., Shoemaker A. R., Penning T. D., ACS Medicinal Chemistry Letters, 4, 211–215 (2013).

13) Harrington P. E., Bourbeau M. P., Fotsch C., Frohn M., Pickrell A. J., Reichelt A., Sham K., Siegmund A. C., Bailis J. M., Bush T., Escobar S., Hickman D., Heller S., Hsieh F., Orf J. N., Rong M., Miguel T. S., Tan H., Zalameda L., Allen J. G., Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 23, 6396–6400 (2013).

14) Hughes S., Elustondo F., Fonzo A. D., Leroux F. G., Wong A. C., Snijders A. P., Matthews S. J., Cherepanov P., Nat Struct Mol Biol, 19, 1101–1107 (2012).

15) Yde C. W., Ermakova I., Issinger O.-G., Niefind K., Journal of Molecular Biology, 347, 399– 414 (2005).

16) Adams J. A., Chemical Reviews, 101, 2271–2290 (2001).

17) Wood E. R., Truesdale A. T., McDonald O. B., Yuan D., Hassell A., Dickerson S. H., Ellis B., Pennisi C., Horne E., Lackey K., Alligood K. J., Rusnak D. W., Gilmer T. M., Shewchuk L., Cancer research, 64, 6652–6659 (2004).

18) Heerding D. A., Rhodes N., Leber J. D., Clark T. J., Keenan R. M., Lafrance L. V., Li M., Safonov I. G., Takata D. T., Venslavsky J. W., Yamashita D. S., Choudhry A. E., Copeland R. A., Lai Z., Schaber M. D., Tummino P. J., Strum S. L., Wood E. R., Duckett D. R., Eberwein D., Knick V. B., Lansing T. J., McConnell R. T., Zhang S., Minthorn E. A., Concha N. O., Warren G. L., Kumar R., Journal of Medicinal Chemistry, 51, 5663–5679 (2008).

19) Iwata H., Imamura S., Hori A., Hixon M. S., Kimura H., Miki H., Biochemistry, 50, 738–751 (2011).

20) Chaikuad A., Tacconi E. M. C., Zimmer J., Liang Y., Gray N. S., Tarsounas M., Knapp S., Nature chemical biology, 10, 853–860 (2014).

21) Lipinski C. A., Lombardo F., Dominy B. W., Feeney P. J., Adv Drug Deliver Rev, 23, 3–25 (1997).

22) Lovering F., Bikker J., Humblet C., Journal of Medicinal Chemistry, 52, 6752–6756 (2009).

23) Nakano H., Saito N., Parker L., Tada Y., Abe M., Tsuganezawa K., Yokoyama S., Tanaka A., Kojima H., Okabe T., Nagano T., Journal of Medicinal Chemistry, 55, 5151–5164 (2012).

参考文献をもっと見る

全国の大学の
卒論・修論・学位論文

一発検索!

この論文の関連論文を見る