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大学・研究所にある論文を検索できる 「Multi-stain to Multi-stain Transformation of High-Resolution Renal Biopsy Images by Generative Adversarial Networks Highlights Glomerular and Interstitial Abnormalities with a Virtual Single-section View」の論文概要。リケラボ論文検索は、全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索できる論文検索サービスです。

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Multi-stain to Multi-stain Transformation of High-Resolution Renal Biopsy Images by Generative Adversarial Networks Highlights Glomerular and Interstitial Abnormalities with a Virtual Single-section View

藥袋(川井) 将敬 山梨大学 DOI:info:doi/10.34429/00005158

2022.03.18

概要

【目的】
腎生検は腎疾患を診断する上で欠くことのできない重要な病理学的検査である。組織的評価には糸 球体、尿細管、間質の詳細な構造観察が必要で、ヘマトキシリン-エオジン(H&E)染色の他に periodic acid Schiff(PAS)染色、periodic acid-methenamine silver(PAM)染色、Masson’s trichrome(MT) 染色といった複数の特殊染色を加えて病理診断を行っている。しかし、複数枚の組織薄切片に対して それぞれの染色を行うため、染色毎に観察される組織所見が異なるという技術的な課題がある。 本研究では人工知能技術である深層ニューラルネットと敵対的生成的ネットワーク(GAN)の方法を 用いて、ある 1 枚の染色標本から他の染色標本を人工的に生成する、擬似染色の病理学的実用化を試 みた。さらに Cycle GANという画像群を相互に変換する GAN のフレームワークを応用し、多染色-多 染色間を擬似的に染色する人工知能、PPHM(PAS-PAM-H&E-MT)-GAN を考案しその性質や臨床的意義に ついて検証した。

【方法】
26例の訓練症例、10例の検証例、9例の半月体検証例を収集し検討を行った。 1)デジタル化された訓練症例の組織切片(WSI)からPAS, PAM, H&E, MTそれぞれ18~20万ほどの 512×512ピクセルの画像を切出し訓練に用いた。3つの同じモデルをそれぞれが少しずつ違った学習の 方法で学習させた。これらの訓練されたモデルを、訓練症例の別切片WSIから切出された2,048×2,048 ピクセルの画像に適用し、人間から見て染色の妥当性(核、尿細管上皮、膠原線維などの色パターン) が高いモデルを選別した。選別されたモデルをそれぞれの染色変換のペアに対応させ、その後の検証に用いた。以上のようなGANモデル、訓練法、モデルの選別法などを総称してPPHM-GANとした。訓練症 例と検証症例の画像についてFrechet inception distance (FID)を計算し、その値と人間の眼で見た 妥当性に大きな乖離がないことを確認した。 2)10例の検証例WSIから4,096×4,096ピクセルの画像を切出し、各染色変換を行った。スパイク、 篆刻像、半月体形成、メサンギウム細胞増殖、糸球体硬化、間質の炎症、間質の線維化および尿細管 萎縮、動脈硬化といった病理学的所見についてその同定のしやすさを4段階で評価した(G, A, Q, B)。 3)2)の検討で半月体形成を同定しやすくなることが確認できたが、1糸球体での検討であっため 更に9例の半月体検証例WSIから24個の糸球体を選出し別途検証した。それぞれの糸球体が含まれるよ うに4,096×4,096ピクセルの画像を切出し、各染色変換を行った。3名の病理医が半月体形成について 同定のしやすさを4段階で評価した(G, A, Q, B)。元の染色から変換後の染色となったことによる各 評価の差を整数値で表し、3名の平均値を最終結果とした。

【結果】
本研究により大きく以下の結果が得られた。 1)PPHM-GANにより生成された画像は、概ね組織構築や細胞の位置を修飾することなく別の染色に擬 似染色されていた。特に尿細管や集合管領域で本物の染色として遜色のない擬似染色を実現した。一 方で、細胞密度が高く複雑な糸球体領域では、変換に伴って核の形状が変化する、病理学的所見が同 定しにくくなる、もしくは間違って同定してしまうような望ましくないアーチファクトもみられた。 2)半月体形成、メサンギウム細胞増加、糸球体硬化、間質の炎症、間質の線維化および尿細管萎縮 といった病理学的所見は、PASもしくはPAMに変換された擬似染色の画像で元の画像よりも同定が容易 になった。 3)24個の糸球体の内、22個で1つ以上の擬似染色画像が元の画像よりも半月体の同定に優れていた。 特にPASをPAMに変換した画像、H&EをPASもしくはPAMに変換した画像、MTをPAMに変換した画像で顕著 であった。

【考察】
本研究から人工知能により一つの染色から複数の染色へ相互に変換することが可能であることが示 された。擬似染色により半月体を筆頭とする病理学的所見の発見が容易になることが確認され、これ は正確な診断および検体から最大限の情報を得ることを可能とし、患者の利益に資するものである。 また一部の擬似染色のクオリティに差があり、染色変換の方向に非対称性があることから、ある染 色によって表現される情報量に差があることが示唆された。多くの症例ではH&Eから他の染色に変換し た画像よりも、他の染色からH&Eに変換した画像で病理所見の同定に有利であり、H&E切片の有する情 報が他の染色よりも少ない可能性が考えられた。実際上は、腎生検の検体においてH&Eよりも他の染色 切片を多く作製し、H&E切片は他の染色切片から変換して代用することが勧められる。

【結論】
同一切片で多染色-多染色間を擬似的に染色する人工知能、PPHM-GAN を開発した。擬似染色は幾つ かの病理所見の同定に有用で、特に半月体形成に関して元の染色画像よりも同定が容易になること (22/24 糸球体)を複数の病理医により確認した。

この論文で使われている画像

参考文献

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