微細藻類等の分子育種に関する研究

概要

令和４年度

京都大学化学研究所 スーパーコンピュータシステム 利用報告書
微細藻類等の分子育種に関する研究
Study on microalgal molecular breeding
京都大学 農学研究科 応用生物科学専攻

澤山 茂樹

研究成果概要
微細藻類やラビリンチュラ類等の真核微生物の一部は、ω３系脂肪酸やカロテノイド等の有
用物質生産能を有している。カロテノイド生合成系に関与する遺伝子には未同定のもの、制
御機構が未解明のものが多く存在している。本研究では、京都大学化学研究所スーパーコン
ピュータシステムを利用し、広範なデータからの注釈付を行うことでそれらの候補遺伝子を探
索し、分子生物学実験に活用している。また、ラビリンチュラ類はω３系脂肪酸の生産源として
近年注目されているが、それらの生態や環境適応については未解明である。当研究室では、
本種の特定の環境変化への分子適応メカニズムを明らかとするため、網羅的転写データを取
得し、その解析も実施している。
発表論文（謝辞あり）
Transcriptome analysis of Aurantiochytrium limacinum under low salt conditions.
Kubo Y, Morimoto D, Kato S, Shiroi M, Ohara K, Higashine T, Mori Y, Yoshimi T, Takeuchi M,
Sawayama S.
J Appl Microbiol. 2023 Jan 23;134(1):lxac004. doi: 10.1093/jambio/lxac004.
PMID: 36626746
Transcriptional responses of Aurantiochytrium limacinum under light conditions.
Kubo Y, Morimoto D, Shiroi M, Yoshimi T, Ohara K, Higashine T, Mori Y, Takeuchi M,
Sawayama S.
J Appl Microbiol. 2022 Jun;132(6):4330-4337. doi: 10.1111/jam.15527. Epub 2022 Apr 1. ...