1 M. J. McPherson, M. R. Parsons and C. M. Wilmot, Handbook of metalloproteins, John Wiley & Sons, Ltd, 2001, vol. 2, pp. 1245–1257.
2 D. L. Wertz and J. P. Klinman, Handbook of metalloproteins, John Wiley & Sons, Ltd, 2001, vol. 2, pp. 1258–1271.
3 M. R. Parsons, M. A. Convery, C. M. Wilmot, K. D. S. Yadav, V. Blakeley, A. S. Corner, S. E. V. Phillips, M. J. Pherson and P. F. Knowles, Structure, 1995, 3, 1171–1184.
4 M. C. J. Wilce, D. M. Dooley, H. C. Freeman, J. M. Guss, H. Matsunami, W. S. McIntire, C. E. Ruggiero, K. Tanizawa and H. Yamaguchi, Biochemistry, 1997, 36, 16116–16133.
5 D. Cai and J. P. Klinman, J. Biol. Chem., 1994, 269, 32039– 32042.
6 T. Murakawa, S. Baba, Y. Kawano, H. Hayashi, T. Yano, T. Kumasaka, M. Yamamoto, K. Tanizawa and T. Okajima, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2019, 116, 135–140.
7 T. Murakawa, T. Okajima, S. Kuroda, T. Nakamoto, M. Taki, Y. Yamamoto, H. Hayashi and K. Tanizawa, Biochem. Biophys. Res. Commun., 2006, 342, 414–423.
8 K. L. Grant and J. P. Klinman, Biochemistry, 1989, 28, 6597– 6605.
9 M. Mure, S. A. Mills and J. P. Klinman, Biochemistry, 2002, 41, 9269–9278.
10 B. Schwartz, E. L. Green, J. Sanders-Loehr and J. P. Klinman, Biochemistry, 1998, 37, 16591–16600.
11 J. Plastino, E. L. Green, J. Sanders-Loehr and J. P. Klinman, Biochemistry, 1999, 38, 8204–8216.
12 J. M. Murray, C. G. Saysell, C. M. Wilmot, W. S. Tambyrajah, J. Jaeger, P. F. Knowles, S. E. V. Phillips and M. J. McPherson, Biochemistry, 1999, 38, 8217–8227.
13 Y.-C. Chiu, T. Okajima, T. Murakawa, M. Uchida, M. Taki, S. Hirota, M. Kim, H. Yamaguchi, Y. Kawano, N. Kamiya, S. Kuroda, H. Hayashi, Y. Yamamoto and K. Tanizawa, Biochemistry, 2006, 45, 4105–4120.
14 S. Kishishita, T. Okajima, M. Kim, H. Yamaguchi, S. Hirota, S. Suzuki, S. Kuroda, K. Tanizawa and M. Mure, J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 1041–1055.
15 Y. Liu, A. Mukherjee, N. Nahumi, M. Ozbil, D. Brown, A. M. Angeles-Boza, D. M. Dooley, R. Prabhakar and J. P. Roth, J. Phys. Chem. B, 2013, 117, 218–229.
16 J. L. DuBois and J. P. Klinman, Biochemistry, 2006, 45, 3178– 3188.
17 T. Murakawa, K. Kurihara, M. Shoji, C. Shibazaki, T. Sunami, T. Tamada, N. Yano, T. Yamada, K. Kusaka, M. Suzuki, Y. Shigeta, R. Kuroki, H. Hayashi, T. Yano, K. Tanizawa, M. Adachi and T. Okajima, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2020, 117, 10818–10824.
18 S. Grimme, S. Antony, S. Ehrlich and H. Krieg, J. Chem. Phys., 2010, 132, 154104.
19 P. J. Hay and W. R. Wadt, J. Chem. Phys., 1985, 82, 270.
20 P. J. Hay and W. R. Wadt, J. Chem. Phys., 1985, 82, 284.
21 P. J. Hay and W. R. Wadt, J. Chem. Phys., 1985, 82, 299.
22 M. Shoji, K. Hanaoka, Y. Ujiie, W. Tanaka, D. Kondo, H. Umeda, Y. Kamoshida, M. Kayanuma, K. Kamiya, K. Shiraishi, Y. Machida, T. Murakawa and H. Hayashi, J. Am. Chem. Soc., 2014, 136, 4525–4533.
23 Y. Abe, M. Shoji, Y. Nishiya, H. Aiba, T. Kishimoto and K. Kitaura, Phys. Chem. Chem. Phys., 2017, 19, 9811–9822.
24 T. Tokiwa, M. Shoji, V. Sladek, N. Shibata, Y. Higuchi, K. Kataoka, T. Sakurai, Y. Shigeta and F. Misaizu, Molecules, 2019, 24(1), 76–87.
25 M. Valiev, E. J. Bylaska, N. Govind, K. Kowaiski, T. P. Straatsma, H. J. J. van Dam, D. Wang, J. Nieplocha, E. Apra, T. L. Windus and W. A. de Jong, Comput. Phys. Commun., 2010, 181, 1477.
26 W. Humphery, A. Dalke and K. Schulten, J. Mol. Graphics, 1996, 14, 33–38.