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Rolling circle amplification(RCA)法により調製される長鎖一本鎖DNA(lss-DNA)を利用した核酸構造体のドラッグデリバリーシステムへの応用に関する研究

伊藤, 公一 京都大学 DOI:10.14989/doctor.k23845

2022.03.23

概要

DNAの二本鎖形成を利用して調製可能な核酸ナノ構造体は、さまざまな三次元構造体を形成することができるが、核酸医薬を効率よく搭載できる、生体由来物質であるために生体適合性に関する懸念が少ない、様々な機能の賦与が可能である等の利点を有することからドラッグデリバリーシステムとしての利用が期待される。Rolling circle amplification(RCA)法により調製される長鎖一本鎖DNA(lss-DNA)は鋳型DNAの高度な反復配列をもつ長鎖のDNAであり、生理活性をもつDNA配列を用いた場合には一分子当たり多価の生理活性配列を導入可能という利点を有する。申請者は、lss-DNAを用いた核酸構造体のドラッグデリバリーシステムの開発を目指し、lss-DNAを用いて形成可能な疎水性相互作用に基づくDNA超分子と細長い棒状構造体であるDNA nanotubeについて研究を行った。

第一章 CpGDNAの免疫細胞への効率的なデリバリーを目的としたDNA超分子の開発
 非メチル化シトシングアニンDNA(CpGDNA)は免疫細胞のエンドソームに発現するToll-like receptor 9に認識され自然免疫を誘導する。CpGDNAは免疫疾患やアレルギー疾患の有用な治療手段となると期待されるが、生体内における易分解性や免疫細胞に対するデリバリー効率の低さが課題となっている。本章ではこれらの問題を解決すべく、CpG配列を反復配列としてもつlss-DNAとcholesterol修飾DNAを組み合わせることにより調製されるDNA超分子を新規に開発した。DNA超分子の形成はゲルシフトアッセイ及び透過型電子顕微鏡観察により確認した。DNA超分子の安定性をウシ胎児血清(FBS)を用いて評価し、DNA超分子が安定性に優れることを見出した。マウスマクロファ-ジ(RAW264.7)細胞にDNA超分子、lss-DNA、CpGDNAを添加後の上清中TNF-α量をELISAにより評価したところ、lss-DNAはCpGDNAに対して20倍のTNF-α産生量を示したのに対しDNA超分子はさらにその3倍のTNF-α産生量を示した。また、細胞毒性をLactate dehydrogenase(LDH)アッセイにより評価したところDNA超分子はRAW264.7細胞に対してほとんど毒性を示さなかった。以上よりDNA超分子は毒性の懸念が少なく高い免疫活性能を持つドラッグデリバリーキャリアとなると考えられる。

第二章 DNA nanotubeの細胞取り込み選択性に関する研究
 核酸構造体のドラッグデリバリーシステムへの応用には細胞取り込み選択性の情報が不可欠である。ナノサイズの核酸構造体の多くは貪食能をもつ免疫細胞に取り込まれやすいことが報告されているが、DNA nanotube等の特異な構造体の細胞取り込み選択性については未だ情報が少ない。そこでDNA nanotubeの細胞取り込み選択性を5種類の細胞株、マウスマクロファ-ジ(RAW264.7)、マウス樹状細胞(DC2.4)、マウス胎児線維芽細胞(NIH3T3)、マウス筋芽細胞(C2C12)、マウスメラノーマ(B16BL6)、ヒト胎児腎細胞(HEK293)を用いて評価を行った。各細胞にFAM標識DNA nanotubeを添加しFACS法により細胞取り込みを比較した結果、NIH3T3及びC2C12に高い蛍光が観察された。DNA nanotubeのNIH3T3細胞による取り込み機構を各種エンドサイトーシス阻害剤を用いて評価したところ、アクチン重合阻害剤であるサイトカラシンB処理群ではDNA nanotubeの取り込みが有意に減少した。また、DNA nanotubeの線維芽細胞による取り込み様式を観察するために、金ナノ粒子(AuNP)標識DNA nanotubeを添加したNIH3T3細胞の細胞超薄切片の透過型電子顕微鏡観察を行った。その結果、DNA nanotubeは添加1時間後の比較的早い時間では細胞表面に分布し、食作用によって取り込まれることが示唆された。また、4時間後では細胞内にDNA nanotubeを含有したAutophagosomeが多数形成されていた。以上、DNA nanotubeはこれまでに報告されていない取り込み特性を示すこと及びその取り込み様式について明らかにした。

第三章 DNA nanotubeの細胞取り込み選択性に対するCollagenの関与
 DNA nanotubeが線維芽細胞に高い細胞取り込み選択性を示したメカニズムとして、線維芽細胞が他の細胞と比較して高く発現するCollagenに着目した。取り込みを評価した上記の5つの細胞株におけるCollagen type Iの発現量をウェスタンブロットにより確認したところ、DNA nanotubeの取り込みとCollagen type Iの発現量は正に相関した。プレートにCollagen type Iを固定しFAM標識DNA nanotubeを添加することで、タンパク質との親和性を測定したところ、DNA nanotubeを形成させることでCollagenへの親和性が上昇した。FITC標識Collagenを作製し酸性条件でNIH3T3細胞に添加することで細胞表面にCollagenを吸着させ、Cy5標識DNA nanotubeを添加し共焦点顕微鏡により観察したところ、細胞内において緑及び赤の蛍光の共局在が観察された。Collagenase処理による細胞表面のCollagenを除去したNIH3T3細胞では、未処理の細胞と比較してDNA nanotubeの細胞取込みが有意に低下した。以上よりDNA nanotubeの線維芽細胞への取り込みにはCollagenが関与すると考えられる。

 以上、申請者はlss-DNAを疎水性相互作用に基づき形成されるDNA超分子とすることでその安定性の改善と、免疫細胞の活性能の増強が可能であることを明らかにした。また、DNA nanotubeは細胞表面のCollagenを介した細胞取り込み特性を示すことを見出した。本研究で提示した知見は、核酸構造体を用いたドラッグデリバリーシステムの開発において有益な情報を提示するものと考える。

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参考文献

1. Gay NJ, Symmons MF, Gangloff M, Bryant CE. Assembly and localization of Toll- like receptor signalling complexes. Nat Rev Immunol. 2014;14(8):546-558. doi:10.1038/nri3713

2. Krieg AM. CpG motifs in bacterial DNA and their immune effects. Annu Rev Immunol. 2002;20:709-760. doi:10.1146/annurev.immunol.20.100301.064842

3. Krieg AM. Therapeutic potential of toll-like receptor 9 activation. Nat Rev Drug Discov. 2006;5(6):471-484. doi:10.1038/nrd2059

4. Klinman DM. Immunotherapeutic uses of CpG oligodeoxynucleotides. Nat Rev Immunol. 2004;4(4):249-258. doi:10.1038/nri1329

5. Fire Andrew, Si-Qun Xu. Rolling replication of short DNA circles. PNAS. 1995;92(Biochemistry):4641-4645.

6. Liu D, Daubendiek SL, Zillman MA, Ryan K, Kool ET. Rolling circle DNA synthesis: Small circular oligonucleotides as efficient templates for DNA polymerases. J Am Chem Soc. 1996;118(7):1587-1594. doi:10.1021/ja952786k

7. Zhang L, Zhu G, Mei L, et al. Self-Assembled DNA Immunonanoflowers as Multivalent CpG Nanoagents. ACS Appl Mater Interfaces. 2015;7(43):24069-24074. doi:10.1021/acsami.5b06987

8. Jung H, Kim D, Kang YY, Kim H, Lee JB, Mok H. CpG incorporated DNA microparticles for elevated immune stimulation for antigen presenting cells. RSC Adv. 2018;8(12):6608-6615. doi:10.1039/c7ra13293j

9. Zhou L, Ou LJ, Chu X, Shen GL, Yu RQ. Aptamer-based rolling circle amplification: A platform for electrochemical detection of protein. Anal Chem. 2007;79(19):7492- 7500. doi:10.1021/ac071059s

10. Al-Ogaili AS, Liyanage R, Lay JO, et al. DNA aptamer-based rolling circle amplification product as a novel immunological adjuvant. Sci Rep. 2020;10(1):1-12. doi:10.1038/s41598-020-79420-w

11. Yata T, Takahashi Y, Tan M, Hidaka K, Sugiyama H. Efficient amplification of self- gelling polypod-like structured DNA by rolling circle amplification and enzymatic digestion. Nat Publ Gr. 2015;(September):1-9. doi:10.1038/srep14979

12. Ouyang X, Li J, Liu H, et al. Rolling circle amplification-based DNA origami nanostructrures for intracellular delivery of immunostimulatory drugs. Small. 2013;9(18):3082-3087. doi:10.1002/smll.201300458

13. Kim KR, Röthlisberger P, Kang SJ, et al. Shaping rolling circle amplification products into DNA nanoparticles by incorporation of modified nucleotides and their application to in vitro and in vivo delivery of a photosensitizer. Molecules. 2018;23(7). doi:10.3390/molecules23071833

14. Hollenstein M, Damha MJ. Rolling circle amplification with chemically modified nucleoside triphosphates. Curr Protoc Nucleic Acid Chem. 2016;67(December):7.26.1-7.26.15. doi:10.1002/cpnc.17

15. Kim JH, Jang M, Kim YJ, Ahn HJ. Design and Application of Rolling Circle Amplification for a Tumor-Specific Drug Carrier. J Med Chem. 2015;58(19):7863- 7873. doi:10.1021/acs.jmedchem.5b01126

16. Zhao H, Yuan X, Yu J, et al. Magnesium-Stabilized Multifunctional DNA Nanoparticles for Tumor-Targeted and pH-Responsive Drug Delivery. ACS Appl Mater Interfaces. 2018;10(18):15418-15427. doi:10.1021/acsami.8b01932

17. Amberlyn M. Peterson, Zhesen Tan, Evelyn M. Kimbrough, Jennifer M. Heemstra. 3,3′-Dioctadecyloxacarbocyanine perchlorate (DiO) as a fluorogenic probe for measurement of critical micelle concentration. Anal Methods. 2015;7(16). doi:10.1039/c5ay01444a

18. Dwight S. Seferos, Andrew E. Prigodich, David A. Giljohann, Pinal C. Patel CAM. Polyvalent DNA Nanoparticle Conjugates Stabilize Nucleic Acids. Nano Lett. 2009;9(1):308–311. doi:10.1021/nl802958f.Polyvalent

19. Li H, Zhang B, Lu X, et al. Molecular spherical nucleic acids. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018;115(17):4340-4344. doi:10.1073/pnas.1801836115

20. Wang Y, Wu C, Chen T, et al. DNA micelle flares: A study of the basic properties that contribute to enhanced stability and binding affinity in complex biological systems. Chem Sci. 2016;7(9):6041-6049. doi:10.1039/c6sc00066e

21. Mohri K, Nishikawa M, Takahashi N, et al. Design and development of nanosized DNA assemblies in polypod-like structures as efficient vehicles for immunostimulatory cpg motifs to immune cells. ACS Nano. 2012;6(7):5931-5940. doi:10.1021/nn300727j

22. Mohri K, Nagata K, Ohtsuki S, et al. Elucidation of the Mechanism of Increased Activity of Immunostimulatory DNA by the Formation of Polypod-like Structure. Pharm Res. 2017;34(11):2362-2370. doi:10.1007/s11095-017-2243-y

23. Hamblin GD, Hariri AA, Carneiro KMM, Lau KL, Cosa G, Sleiman HF. Simple design for DNA nanotubes from a minimal set of unmodified strands: Rapid, room- temperature assembly and readily tunable structure. ACS Nano. 2013;7(4):3022- 3028. doi:10.1021/nn4006329

24. Hamblin GD, Carneiro KMM, Fakhoury JF, Bujold KE, Sleiman HF. Rolling circle amplification-templated DNA nanotubes show increased stability and cell penetration ability. J Am Chem Soc. 2012;134(6):2888-2891. doi:10.1021/ja2107492

25. Lizardi PM, Huang X, Zhu Z, Bray-Ward P, Thomas DC, Ward DC. Mutation detection and single-molecule counting using isothermal rolling-circle amplification. Nat Genet. 1998;19(3):225-232. doi:10.1038/898

26. Van Amersfoort ES, Van Strijp JAG. Evaluation of a flow cytometric fluorescence quenching assay of phagocytosis of sensitized sheep erythrocytes by polymorphonuclear leukocytes. Cytometry. 1994;17(4):294-301. doi:10.1002/cyto.990170404

27. Busetto S, Trevisan E, Patriarca P, Menegazzi R. A Single-Step, Sensitive Flow Cytofluorometric Assay for the Simultaneous Assessment of Membrane-Bound and Ingested Candida albicans in Phagocytosing Neutrophils. Cytom Part A. 2004;58(2):201-206. doi:10.1002/cyto.a.20014

28. Nuutila J, Lilius EM. Flow cytometric quantitative determination of ingestion by phagocytes needs the distinguishing of overlapping populations of binding and ingesting cells. Cytom Part A. 2005;65(2):93-102. doi:10.1002/cyto.a.20139

29. Illien F, Rodriguez N, Amoura M, et al. Quantitative fluorescence spectroscopy and flow cytometry analyses of cell-penetrating peptides internalization pathways: Optimization, pitfalls, comparison with mass spectrometry quantification. Sci Rep. 2016;6(April):1-13. doi:10.1038/srep36938

30. Wang P, Rahman MA, Zhao Z, et al. Visualization of the Cellular Uptake and Trafficking of DNA Origami Nanostructures in Cancer Cells. J Am Chem Soc. 2018;140(7):2478-2484. doi:10.1021/jacs.7b09024

31. Umemura K, Ohtsuki S, Nagaoka M, et al. Critical contribution of macrophage scavenger receptor 1 to the uptake of nanostructured DNA by immune cells. Nanomedicine Nanotechnology, Biol Med. 2021;34:102386. doi:10.1016/j.nano.2021.102386

32. Maezawa T, Ohtsuki S, Hidaka K, et al. DNA density-dependent uptake of DNA origami-based two-or three-dimensional nanostructures by immune cells. Nanoscale. 2020;12(27):14818-14824. doi:10.1039/d0nr02361b

33. Karsdal MA, Nielsen SH, Leeming DJ, et al. The good and the bad collagens of fibrosis – Their role in signaling and organ function. Adv Drug Deliv Rev. 2017;121:43-56. doi:10.1016/j.addr.2017.07.014

34. Myllyharju J, Kivirikko KI. Collagens and collagen-related diseases. Ann Med. 2001;33(1):7-21. doi:10.3109/07853890109002055

35. Mrevlishvili GM, Svintradze D V. Complex between triple helix of collagen and double helix of DNA in aqueous solution. Int J Biol Macromol. 2005;35(5):243-245. doi:10.1016/j.ijbiomac.2005.02.004

36. Kaya M, Toyama Y, Kubota K, et al. Effect of DNA structure on the formation of collagen-DNA complex. Int J Biol Macromol. 2005;35(1-2):39-46. doi:10.1016/j.ijbiomac.2004.11.005

37. Ochiya T, Takahama Y, Nagahara S, et al. New delivery system for plasmid DNA in vivo using atelocollagen as a carrier material: The Minipellet. Nat Med. 1999;5(6):707-710. doi:10.1038/9560

38. Harris JR, Reiber A. Influence of saline and pH on collagen type I fibrillogenesis in vitro: Fibril polymorphism and colloidal gold labelling. Micron. 2007;38(5):513-521. doi:10.1016/j.micron.2006.07.026

39. McAlinden A, Havlioglu N, Liang L, Davies SR, Sandell LJ. Alternative splicing of type II procollagen exon 2 is regulated by the combination of a weak 5′ splice site and an adjacent intronic stem-loop cis element. J Biol Chem. 2005;280(38):32700- 32711. doi:10.1074/jbc.M505940200

40. Alexakis C, Partridge T, Bou-Gharios G. Implication of the satellite cell in dystrophic muscle fibrosis: A self-perpetuating mechanism of collagen overproduction. Am J Physiol - Cell Physiol. 2007;293(2). doi:10.1152/ajpcell.00061.2007

41. Svintradze D V, Mrevlishvili GM, Metreveli N, et al. Collagen – DNA Complex. Biomacromolecules. 2008;9:21-28.

42. Sprangers S, Everts V. Molecular pathways of cell-mediated degradation of fibrillar collagen. Matrix Biol. 2019;75-76:190-200. doi:10.1016/j.matbio.2017.11.008

43. Varma S, Orgel JPRO, Schieber JD. Nanomechanics of Type I Collagen. Biophys J. 2016;111(1):50-56. doi:10.1016/j.bpj.2016.05.038

44. Wang P, Gaitanaros S, Lee S, Bathe M, Shih WM, Ke Y. Programming Self- Assembly of DNA Origami Honeycomb Two-Dimensional Lattices and Plasmonic Metamaterials. J Am Chem Soc. 2016;138(24):7733-7740. doi:10.1021/jacs.6b03966

45. Sun W, Ji W, Hall JM, et al. Self-Assembled DNA Nanoclews for the Efficient Delivery of CRISPR-Cas9 for Genome Editing. Angew Chemie. 2015;127(41):12197- 12201. doi:10.1002/ange.201506030

46. Mo R, Jiang T, Disanto R, Tai W, Gu Z. ATP-triggered anticancer drug delivery. Nat Commun. 2014;5:1-10. doi:10.1038/ncomms4364

47. Everts V, Beertsen W. The Role of Microtubules in the Phagocytosis of Collagen by Fibroblasts. Top Catal. 1987;7(1):1-15. doi:10.1016/S0174-173X(87)80017-1

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