リケラボ論文検索は、全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索できる論文検索サービスです。

リケラボ 全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索するならリケラボ論文検索大学・研究所にある論文を検索できる

リケラボ 全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索するならリケラボ論文検索大学・研究所にある論文を検索できる

大学・研究所にある論文を検索できる 「牛伝染性リンパ腫ウイルスの系統進化学的研究」の論文概要。リケラボ論文検索は、全国の大学リポジトリにある学位論文・教授論文を一括検索できる論文検索サービスです。

コピーが完了しました

URLをコピーしました

論文の公開元へ論文の公開元へ
書き出し

牛伝染性リンパ腫ウイルスの系統進化学的研究

西角 光平 東京農業大学

2022.09.01

概要

牛伝染性リンパ腫(EBL)は,牛伝染性リンパ腫ウイルス(BLV)の感染に起因する牛の疾病で,悪性腫瘍を主徴とする。発症した牛は,死亡または出荷不可による全部廃棄が適用されることから,畜産農家における経済的損失は極めて大きい。本疾病は1871年にドイツで初めて報告されて以降,急速に世界中へ拡大していった。日本では,1927年の初報告からしばらくは局所的な発生が続いていたが,その後急速に日本各地に広がり,現在では約40%の牛がBLVに感染している。パンデミック化の様相を呈している本疾病は,効果的なワクチンや治療法がないことから,今後さらなる被害拡大が予想される。感染症の急速な国際化は,畜産業だけでなく公衆衛生的にも大きな問題になると考えられる。感染症の流行に対策を講じる際,まず初めに「どんな病原体」が「いつから」どういった「経路」で感染を広げているのかを解明することが重要である。家畜感染症の原因ウイルスの地理的分布,拡散時期・経路,集団動態などの知見は,動物防疫や効果的な防除方法開発などの発展に貢献することが期待される。本研究では,BLVのゲノム情報を用いた系統進化学的アプローチにより,BLVの時間尺度と拡散経路を推定し,発生と拡散の歴史を明らかにした。

 日本における流行初期のBLV配列情報を得るために,1972年から2000年の間にEBLと診断された牛の病理組織標本(FFPE標本)28検体からBLVゲノムの増幅を試み,8検体においてenv-gp51全長配列を決定することができた。データベースに登録されているBLVenv-gp51領域192配列と合わせた200配列を用いて分子進化的に解析した。時間尺度(分岐年代)および拡散経路については,配列情報と疫学情報(そのウイルスの検体採取年および採取場所)を組み合わせて推定を試みた。分子系統解析の結果から,本ウイルスは1-10型の遺伝子型に分類され,世界的に流行している1型以外には地域特異性がみられた。BLVは約200年前に,共通の祖先と考えられる集団から分岐し,アジアおよび南米に分布する6,10型,ヨーロッパに分布する4,7,8型,そして,それらの少し後に世界的に流行している1型とアジア・北南米の2,3,9型に広がっていることが明らかとなった。特に1型は1900年代初頭に出現し,1900年代中頃にアメリカから世界各国に拡散していることがわかった。1800年代は,ヨーロッパにおいて品種改良が活発に行われており,1900年代に入るとその中心はアメリカへと移った。第二次世界大戦後の1950年代以降には,牛の輸出入が活発化した。このことから,貿易や品種改良に伴う牛の移動により,BLVが世界中へ拡大していったことが示唆された。

 FFPE標本から得た配列を解析した結果,現在日本で流行しているBLVは1型で,1930年代から1980年代の間に国外から複数回持ち込まれたことが示唆され,アメリカおよび中南米と祖先を同じくすることがわかった。さらに,1970年代から日本のBLVにおける集団サイズが増加していたことから,この時期に牛の輸入に伴い国外からBLVが侵入し,日本中に広がったと思われる。実際に,1970代年以降には牛の生体輸入の自由化によりアメリカから牛の輸入数が増加しており,国外から家畜を導入することは,常に日本に感染症を蔓延させるリスクになると示唆された。

 遺伝子型が地域特異性を示しており,BLVの流行や拡散経路における重要な情報をもつことが本研究で明らかとなった。近年,安価で迅速な遺伝子型判別方法として,PCR-RFLP法を用いたBLVの分子疫学的解析が行われているが,最近報告された7型-10型までは網羅されていない。本研究では,BLV遺伝子型1型から10型を対象とし,新規PCR-RFLP法による遺伝子型判別方法について検討した。まず,データベースに登録されているBLVenv-gp51領域(444bp)の配列を用いて,ML系統樹を推定した。それを基に,各遺伝子型について194種類の制限酵素による切断パターンをin silicoで解析した。次に,遺伝子型判別に有効なものを数種類抽出し,遺伝子型判別のためのフローチャートを作成した。最後に,抗体陽性牛のDNAを用いて,in vivoで検証実験を行なった。その結果,遺伝子型判別に有効な制限酵素は7種類あり,10型全てを分類することができた(系統解析との一致率92%)。本方法は,塩基配列を決定する必要がなく,安価で迅速かつ正確性に優れているため,家畜保健衛生所などの現場において大規模なスクリーニングを実施することが可能である。また,BLVの流行動態や伝播経路を把握することに活用できる。

 以上の結果から,本研究ではBLVの時間尺度と拡散経路を初めて明らかにした。また,BLVの流行と進化は,近代における畜産の発展や政治的・社会的背景と関連していることを明らかにした。感染症の国際化が進む中,病原体は宿主動物の移動とともに分布域を拡大させていくことから,防除対策としてサーベイランスの強化や防疫の重要性を示す。

この論文で使われている画像

参考文献

1) Kanapen K, Kerkhofs P, and Mannerickx M. 1993. Eradication of enzootic bovine leukosis in Belgium:Results of the mass detection on the national cattle population in 1989, 1990 and 1991. Ann. Med. Vet.137:197-201.

2) 農林水産省. 2021. 監視伝染病の発生状況. [Online] https://www.maff.go.jp/j/syouan/douei/kansi_densen/attach/pdf/kansi_de nsen-10.pdf.

3) OIE. The 117 OIE-Listed diseases. [Online] https://www.oie.int/en/what- we-do/animal-health-and-welfare/animal-diseases/old-classification-of- diseases-notifiable-to-the-oie-list-b/.

4) OIE. 2021. Terrestrial Animal Health Code: Chapter 1.3. DISEASES, INFECTIONS AND IFFESTATIONS LISTED BY THE OIE. [Online] https://www.oie.int/fileadmin/Home/eng/Health_standards/tahc/current/c hapitre_oie_listed_disease.pdf.

5) Rodriguez SM, Florins A, Gillet N, de Brogniez A, Sanchez-Alcaraz MT, Boxus M, Boulanger F, Gutierrez G, Trono K, Alvarez I, Vagnoni L and Willems L. 2011. Preventive and therapeutic strategies for bovine leukemia virus: lessons for HTLV. Viruses. 3:1210-1248.

6) Sagata N, Yasunaga T, Tsuzuku-Kawamura J, Ohishi K, Ogawa Y and Ikawa Y. 1985. Complete nucleotide sequence of the genome of bovine leukemia virus: its evolutionary relationship to other retroviruses. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 82:677-681.

7) Gillet N, Florins A, Boxus M, Burteau C, Nigro A, Vandermeers F, Balon H, Bouzar AB, Defoiche J, Burny A, Reichert M, Kettmann R and Willems L. 2007. Mechanisms of leukemogenesis induced by bovine leukemia virus: Prospects for novel anti-retroviral therapies in human. Retrovirology 4:18.

8) Barez PY, Brognies AD, Carpentier A, Gazon H, Gillet N, Gutierres G, Hamaidia M, Jacques JR, Perike S, Sriramareddy SN, Renotte N, Staumont B, Reichert M, Trono K and Willems L. 2015. Recent Advances in BLV Research. Viruses. 7:6080-6088.

9) Kattmann R, Meunier-Rotival M, Cortadas J, Cuny G, Ghysdael J, Mammerickx M, Burny A and Bernardi G. 1979. Integration of bovine leukemia virus DNA in the bovine genome. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 76: 4822-4826.

10) Burny A, Cleuter Y, Kettmann R, Mammerickx M, Marbaix G, Portetelle D, van den Broeke A, Willems L and Thomas R. 1988. Bovine leukaemia: Facts and hypotheses derived from the study of an infectious cancer. Vet. Microbiol. 17:197-218.

11) Ferrer JF, Marshak RR, Abt DA and Kenyon SJ. 1978. Persistent lymphocytosis in cattle: Its cause, nature and relation to lymphosarcoma. Ann. Rech. Vet. 9:851-857.

12) Ferrer JF, Marshak RR, Abt DA and Kenyon SJ. 1979. Relationship between lymphosarcoma and persistent lymphocytosis in cattle: A review. J. Am. Vet. Med. Assoc. 175:705-708.

13) Kettmann R, Burny A, Callebaut I, Droogmans L, Mammerickx M, Willems L and Portetelle D. 1994. Bovine leukemia virus. In: Levy J. [ed] The Retroviridae Vol. 3. pp.39-81, Plenum Press. NewYork.

14) Hopkins SG and DiGiacomo RF. 1997. Natural transmission of bovine leukemia virus in dairy and beef cattle. Vet. Clin. North. Am. Food. Anim. Pract. 13:107-128.

15) van der Maaten MJ, Miller JM and Schmerr MJ. 1981. In utero transmission of bovine leukemia virus. Am. J. Vet. Res. 42:1052-1054.

16) 農林水産省. 2015. 牛白血病に関する衛生対策ガイドライン [Online] https://www.maff.go.jp/j/syouan/douei/pdf/ebl_guide.pdf.

17) Leisering A. 1871. Hypertrophy der Malpighischen Körperoen der Milz. Berl. Vet. West. Kgr. Sachsen 16:15-16.

18) Bollinger, O (1874) Über Leukämie bei den Haustieren. Virchows Arch. 59:341-349.

19) Siedamgrotzky O, Hofmeister V (1876) Anleitung zur mikroskopischen und chemischen Diagnostik der Krankheiten der Hausthiere : für Thierärzte und Landwirthe. Schönfeld 192.

20) EFSA Panel on Animal Health and Welfare. 2015. Scientific opinion on enzootic bovine leukosis. EFSA J. [Online] 10.2903/j.efsa.2015.4188.

21) Marawan MA, Alouffi A, Tokhy S EI, Badawy S, Shirani I, Dawood A, Guo A, Almutairi MM, Alshammari FA and Selim A. 2021. Bovine Leukemia Virus: Current Epidemiological Circumstance and Future Prospective. Viruses. 13:2167.

22) Polat M, Takeshima S and Aida Y. 2017. Epidemiology and genetic diversity of bovine leukosis virus. Virol. J. 14:209.

23) 窪田五郎.1927.淋巴肉腫の一例.40:375-378,中央獣医誌.

24) 吉川堯ら.1971.牛白血病の十和田地方における集中発生.第72回日本獣医学会記事.

25) 岩間公男ら.1983.と畜検査からみた家畜腫瘍の検出状況について.11:21-28.獣医科学と統計利用.

26) 森泰良ら.1976.大分県における牛白血病の発生/73:27-36.農林水産省家畜衛生試験場研究報告.

27) Ito T. 1987. Statistics on regional prevalence of gp antibody against bovine leukosis virus in Japan. Bull. Natl. Inst. Anim. Health 90:35-60.

28) Murakami K, Kobayashi S, Konishi M, Kameyama K, Tsutui T. 2013. Nationwide survey of bovine leukemia virus infection among dairy and beef breeding cattle in Japan from 2010-2011. J. Vet. Med. Sci. 75:1123- 1126.

29) Polat M, Takeshima SN, Hosomichi K, Kim J, Miyasaka T, Yamada K, Arainga M, Murakami T, Matsumoto Y, de la Barra Diaz V, Panei CJ, Gonzalez ET, Kanemaki M, Onuma M, Giovambattista G and Aida Y. 2016. A new genotype of bovine leukemia virus in South America identified by NGS-based whole genome sequencing and molecular evolutionary genetic analysis. Retrovirology. 13:4.

30) Lee E, Kim EJ, Ratthanophart J, Vitoonpong R, Kim BH, Cho IS, Song JS, Lee KK and Shin YK. 2016. Molecular epidemiological and serological studies of bovine leukemia virus (BLV) infection in Thailand cattle. Infect. Genet. Evol. 41:245-254.

31) Aiewsakun P, Pamornchainavakul N and Inchaisri C. 2020. Early origin and global colonization of foot-and-mouth disease virus. Sci. Rep. 10:15268.

32) Rios L, Coronado L, Naranjo-Feliciao, Martinez-Perez O, Perera CL, Hernandez-Alvarez L, de Arce HD, Nunez JI, Ganges L and Perez LJ. 2017. Deciphering the emergence, genetic diversity and evolution of classical swine fever virus. Sci. Rep. 7:17887.

33) Kwon T, Yoon SH, Kim KW, Caetano-Anolles K, Cho S and Kim H. 2015. Time-Calibrated Phylogenomics of the Classical Swine Fever Viruses: Genome-Wide Bayesian Coalescent Approach. PLOS ONE. 10(3):e0121578.

34) Kilpatrick AM, Chmura AA, Gibbons DW, Fleischer RC, Marra PP and Daszak P. 2006. Predicting the global spread of H5N1 avian influenza. PNAS. 103:19368-19373.

35) Lee DH, Bertran K, Kwon JH and Swayne DE. 2017. Evolution, global spread, and pathogenicity of highly pathogenic avian influenza H5Nx clade 2.3.4.4. J. Vet. 18:269-280.

36) Lycett SJ, Duchatel F, Digard P. 2019. A brief history of bird flu. Phil. Trans. R. Soc. B 374: 20180257.

37) Alkhamis MA, Aguilar-Vega C, Fountain-Jones NMLin K, Perez AM and Sanchez-Vizcaino JM. 2020. Global emergence and evolutionary dynamics of bluetongue virus. Sci. Rep. 10:21677.

38) Korber B, Muldoon M, Theiler J, Gao F, Lapedes A, Hahn BH, Wolinsky S and Bhattachaya T. 2000. Timing the ancestor of the HIV-1 pandemic strain. Science. 288:1789-1796.

39) Worobey M, Gemmel M, Teuwen DE, Haselkorn T, Kunstman K, Bunce M, Muyembe JJ, Kabonbo JMM, Kalengayi RM, Marck EV, Gilbert MTP and Wolinsky SM. 2008. Direct evidence of extendive diversity of HIV-1 in Kinshasa by 1960. Nature. 455:661-664.

40) Worobey M, Watts TD, McKay RA, Suchard MA, Granade T, Teuwen DE, Koblin BA, Heneine W, Lemey P and Jaffe H. 2016. 1970s and ‘Patient 0’ HIV-1 genomes illuminate early HIV/AIDS history in North America. Nature. 539:98-101.

41) Lemey P, Pybus OG, Wang B, Saksena NK, Salemi M and Vandamme AM. 2003. Tracing the origin and history of the HIV-2 epidemic. PNAS. 100:6588-6592.

42) Bahl J, Krauss S, Kuhnert D, Fourment M, Raven G, Pryor SP, Niles LJ, Danner A, Walker D, Mendenhall IH, Su YC, Dugan VG, Halpin RA, Stockwell TB, Webby RJ, Wentworth DE, Drummond AJ, Smith GJ and Wabster RG. 2013. Influenza A virus migration and persistence in North American wild birds. PLOS pathog. 9:e1003570.

43) Holmes EC, Dudas G, Rambaut A and Andersen KG. 2016. The Evolution of Ebola virus: Insights from the 2013-2016 Epidemic. Nature. 538:193- 200.

44) Chao DL, Halloran ME and Longini Jr. IM. 2010. School opening dates predict pandemic influenza A (H1N1) epidemics in the USA. J. Infect. Dis. 202:877-880.

45) Brenner B, Wainberg MA and Roger M. 2013. Phylogenetic inferences on HIV-1 transmission: implications for the design of prevention and treatment interventions. AIDS. 27:1045-1057.

46) Hayati M, Biller Priscila and Colijn C. 2020. Predicting the short-term success of human influenza virus variants with machine learning. Proc. R. Soc. 287:20200319.

47) Weber MN, Wolf JM, da Silva MS, Mosena ACS, Budaszewski RF, Lunge VR and Canal CW. 2021. Insight into the origin and diversification of bovine viral diarrhea virus 1 subtypes. Arch. Virol. 166:607-611.

48) Molaee V, Bazzucchi M, De Mia GM, Otarod V, Adbollahi D, Rosati S and Luhken G. 2020. Phylogenetic analysis of small ruminant lentiviruses in Germany and Iran suggests their expansion with domestic sheep. Sci. Rep. 10:2243.

49) 椎野禎一郎、杉浦亙.2014.大規模ウイルス遺伝子配列解析からみた本邦のHIV-1流行動態.J.AIDSRes.16:137-142.

50) 三浦定夫.1978.牛の白血病.Ⅰ一般概念:3-9.三浦定夫教授定年退官記念事業会.

51) 家畜衛生30年の歩み.1980.第1章:139-145.岩手県家畜保健衛生30周年記念事業実行委員会.

52) Kumar S, Stecher G and Tamura K. 2016. MEGA7: molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol. Biol. Evol. 33:1870-1874.

53) Rambaut A, Lam TT, Max Carvalho L and Pybus OG. 2016. Exploring the temporal structure of heterochronous sequences using TempEst (formerly Path-O-Gen). Virus Evol. 2:vew007.

54) Bouckaert R, Heled J, Kühnert D, Vaughan T, Wu CH, Xie D, Suchard MA, Rambaut A and Drummond AJ. 2014. BEAST 2: a software platform for Bayesian evolutionary analysis. PLOS Comput. Biol. 10:e1003537.

55) Rambaut A and Drummond A. 2009. Tracer v1.5. [online] available at http://beast.bio.ed.ac.uk/Tracer.

56) Rambaut A and Drummond A. 2016. TreeAnnotator version 1.8.0. [online] available at http://beast.bio.ed.ac.uk.

57) Rambaut A. 2019. Molecular evolution, phylogenetics and epidemiology: Figtree v1.4.4.[online] available at http://beast.bio.ed.ac.uk/software/figtree/.

58) Dedhia P, Tarale S, Dhongde G, Khadapkar R and Das B. 2007. Evaluation of DNA extraction methods and real time PCR optimization on formalin-fixed paraffin-embedded tissues. Asian Pac. J. Cancer Prev. 8:55- 59.

59) Dietrich D, Uhl B, Sailer V, Holmes EE, Jung M, Meller S and Kristiansen G. 2013. Improved PCR performance using template DNA from formalin- fixed and paraffin-embedded tissues by overcoming PCR inhibition. PLoS One 8:e77771.

60) Feldman MY. 1973. Reactions of nucleic acids and nucleoproteins with formaldehyde. Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 13:1-49.

61) Bolognesi C, Forcato C, Buson G, Fontana F, Mangano C, Doffini A, Sero V, Lanzellotto R, Signorini G, Calanca A, Sergio M, Romano R, Gianni S, Medoro G, Giorgini G, Morreau H, Barberis M, Corver WE and Manaresi N. 2016. Digital sorting of pure cell populations enables unambiguous genetic analysis of heterogeneous formalin-fixed paraffin-embedded tumors by next generation sequencing. Sci. Rep. 6:20944.

62) Kocjan BJ, Hošnjak L and Poljak M. 2015. Commercially available kits for manual and automatic extraction of nucleic acids from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissues. Acta Dermatovenerol. Alp. Panonica Adriat. 24:47-53.

63) Johnson R and Kaneene JB. 1992. Bovine leukemia virus and enzootic bovine leukosis. Vet. Bull. 62:287-312.

64) Coulston J, Naif H, Brandon R, Kumar S, Khan S, Daniel RC and Lavin MF. 1990. Molecular cloning and sequencing of an Australian isolate of proviral bovine leukaemia virus DNA: comparison with other isolates. J. Gen. Virol. 71:1737-1746.

65) Fechner H, Blankenstein P, Looman AC, Elwert J, Geue L, Albrecht C, Kurg A, Beier D, Marquardt O and Ebner D. 1997. Provirus variants of the bovine leukemia virus and their relation to the serological status of naturally infected cattle. Virology 237:261-269.

66) Kettmann R, Couez D and Burny A. 1981. Restriction endonuclease mapping of linear unintegrated proviral DNA of bovine leukemia virus. J. Virol. 38:27-33.

67) Licursi M, Inoshima Y, Wu D, Yokoyama T, González ET. and Sentsui H. 2002. Genetic heterogeneity among bovine leukemia virus genotypes and its relation to humoral responses in hosts. Virus Res. 86:101-110.

68) Mamoun RZ, Morisson M, Rebeyrotte N, Busetta B, Couez D, Kettmann R, Hospital M and Guillemain B. 1990. Sequence variability of bovine leukemia virus env gene and its relevance to the structure and antigenicity of the glycoproteins. J. Virol. 64:4180-4188.

69) Sahashi Y, Oshima M, Yamagishi J, Muramatsu C, Shimizu K and Inoshima Y. 2021. Bovine leukemia virus genotype surveillance in cattle at a slaughterhouse in Aichi Prefecture, Japan, in 2019 using polymerase chain reaction combined with restriction fragment length polymorphism. J. Vet. Med. Sci. 83:1730-1734

70) Suto A, Iwata R and Park CH. 2012. Genotyping of Bovine Leukemia Virus Circulating in Yamagata Prefecture. J. Jpn. Vet. Med. Assoc. 65:883-887.

71) Fechner H, Blankenstein P, Looman AC, Elwert J, Geue L, Albrecht C, Kurg A, Beier D, Marquardt O and Ebner D. 1997. Provirus variants of the bovine leukemia virus and their relation to the serological status of naturally infected cattle. Virology 237:261-269.

72) Yang Y, Kelly PJ, Bai J, Zhang R and Wang C. 2016. First molecular characterization of bovine leukemia virus infections in the Caribbean. PLoS One 11:e0168379.

73) Nishikaku K, Noguchi T, Murakami S, Torii Y and Kobayashi T. 2022. Molecular analysis of bovine leukemia virus in early epidemic phase in Japan using archived formalin fixed paraffin embedded histopathological specimens. J. Vet. Med. Sci. 84:350-357.

74) Nishikaku K, Ishiukura R, Ohnuki N, Polat M, Aida Y, Murakami S and Kobayashi T. 2019. Broadly applicable PCR restriction fragment length polymorphism method for genotyping bovine leukemia virus. J. Vet. Med. Sci. 81:1157-1161.

75) 西角光平、小林朋子.2020.日本における牛白血病の発生と拡散の歴史.日本獣医史学雑誌.58:12-19.

76) Tamura G. 2004. Pathology and Clinical Medicine. pp. 371–375. vol. 22 an extra ed. Bunkodo. Tokyo.

77) Ohnuki N, Kobayashi T, Matsuo M, Nishikaku K, Kusama K, Torii Y, Inagaki Y, Hori M, Imakawa K and Satou Y. 2021. A target enrichment high throughput sequencing system for characterization of BLV whole genome sequence, integration sites, clonality and host SNP. Sci. Rep. 11:4521.

78) 和牛育種改良の軌跡.1995.農業研究8号.

79) 広瀬可恒.1971.酪農バンドブック.第1版.養賢堂.東京.

80) 明石博臣ら.2004.動物の感染症.第2版.近代出版.東京.

参考文献をもっと見る

全国の大学の
卒論・修論・学位論文

一発検索!

この論文の関連論文を見る