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糸状菌の液体培養時の菌糸凝集メカニズムの解明とその物質生産への応用

宮澤 拳 東北大学

2020.03.25

概要

真菌は地球上に150万種以上生息し、地球規模の物質循環における分解者として重要な役割を担っている[1]。糸状菌は様々な環境に適応し、多様な代謝能を有することから、酵素や化成品などの生産に利用されている種も多く存在する[2-4]。糸状菌を用いた有用物質の工業生産は、栄養や誘導基質の拡散が容易な液体培養で行われることが一般的で、その生産スケールは数百kLにも及ぶ。糸状菌は培養条件に依存してペレット状からパルプ状まで様々な形態を示すが[5]、この性質が発酵生産効率の不安定要因となっている。しかしながら、糸状菌の形態を完全に制御する手法は確立されておらず、発酵産業における課題となっている。液体培養における糸状菌のペレット形成には細胞表層の因子が関与すると考えられるが、その要因については形態学的なアプローチがなされるにとどまっており、根本的なペレット形成の要因については明らかになっていなかった。

 糸状菌の液体培養条件下の形態の違いは培養条件に強く依存しており、目的生産物の生産性と強い相関がある[6]。ペレット形成時にはその直径が数mmにもなり、ペレット内部への栄養や酸素供給が制限される[6]。酸素や栄養供給はペレット表面から約200μmまでしか十分でないことも報告されている[7]。菌糸がペレットを形成する場合、培養液はニュートン性1を示す[8]。一方、菌糸が分散状態の場合には、培養液粘度が上昇し、攪拌効率が悪化する[6]。加えて、培養液が強い非ニュートン性2を示すため、対流酸素輸送が制限される[6]。Aspergillus属菌は通常、ペレット形態をとることが多い[7, 9-13]。Trichoderma属菌はセルラーゼの生産に用いられる産業菌であるが、通常は分散状態を取る[14, 15]。Penicillium属菌はペレットを形成する[16, 17]。クモノスカビRhizopus oryzaeは通常分散形態をとるが、その場合の粘度上昇が顕著なため、ペレット形成条件が探索されている[18-21]。Neurospora属菌も一般的にはペレットを形成する[22]。そのほか、担子菌Phanerochaete属菌[23]や子嚢菌(冬虫夏草)Cordyceps属菌[24]、Caldariomyces属菌[25]においてペレットを形成することが報告されている。高橋と山田は1959年、ペレットの形成過程は2通りあり、分生子が発芽前に凝集する”凝集型”と、個々の菌糸が独立して分岐生長を続けた結果ペレット状になる”非凝集型”に分けられると報告した[26]。この二つの型は培養条件にも影響されるが、主としてその菌株の特性によるものであると考えられており、Aspergillus nigerは凝集型を、Penicillium chrysogenumは非凝集型をとると考えられている[26]。このモデルは近年でも支持されている[5, 27]。A. nigerにおいては塊の形成が顕著であるが、本菌の産業的な重要性が高いことから、morphology engineeringという学問分野としてその形態制御が議論されている。従来のアプローチ方法として、攪拌回転数や温度、pH、接種分生子数の制御によってその凝集性を制御することが試みられてきた[4, 28-32]。近年になって、”modern morphology engineering techniques”として、微粒子の添加によるペレットサイズの低減[7, 33, 34]や、浸透圧によるペレット形態の制御手法[35]とそれに伴う生産性改善が報告されている。これらの手法により、形態学的な観点からの菌糸ペレットの制御手法は大きく進歩してきたが、生物学的なペレット形成のメカニズムやその形成因子については依然不明のままであった。

 菌糸のペレット形成には細胞表層の因子が関与することが推察される。糸状菌の菌糸の表面は多糖を主成分とした細胞壁に覆われている(Fig.0-1)。細胞壁は細胞形態の維持や細胞の保護、細胞外情報の細胞内への伝達など、生育に必須の役割を担っている。また、細胞壁は菌が外界(宿主細胞、基質および菌自身の細胞)と最初に接触する構造体であることから[36]、細胞壁の構造を理解することは真菌に起因する感染症や発酵生産効率の制御に重要であると考えられる。細胞壁は多糖が複雑に絡み合った構造体でありながら、常に合成と再構築が繰り返される高度に動的な構造体でもある[37]。細胞壁を構成する主要な多糖として、α-グルカン(α-1, 3-グルカンおよび少量のα-1, 4-グルカン)、β-グルカン(β-1, 6分岐β-1, 3-グルカン)、キチン、ガラクトマンナンが知られている[36, 38, 39]。細胞壁にはガラクトマンノプロテイン、GPI-アンカー型タンパク質、細胞壁タンパク質も含まれており、細胞外情報の伝達や細胞壁再構築における役割を有する[40]。真菌の中には、細胞壁の外側に細胞外マトリクス(ECM)を有する種も存在する。ECMは多糖やタンパク質、脂質、核酸からなり、バイオフィルムの構成因子として知られている[39]。また、ECMは菌種によって非常に多様性が高い[38]。Aspergillus属糸状菌においては、ECMに含まれる多糖としてガラクトサミノガラクタン(GAG)やα-1,3-グルカン、ガラクトマンナンが知られている[41, 42]。

 α-1, 3-グルカンは以前より真菌類(A. niger, Cryptococcus, Schizosaccharomyces pombe, Polyporus, Paracoccideoides)の細胞壁に含まれていることが知られていたが[43-46]、その機能については長年理解されていなかった。1970年代にZonneveldがAspergillus nidulansの細胞壁の貯蔵多糖であることを見出し、その生物学的機能について詳細に解析した[47-51]。その後、San-BlasらがParacoccideoides brasiliensisにおいてα-1, 3-グルカンと病原性との関係性について初めて報告した[52]。GoldmanらがHistoplasma capsulatumにおいてα-1, 3-グルカンの病原性への関与を示唆すると[53, 54]、病原性二形性真菌P. braciliensis[52, 55-58]、Brastomyces dermititidis[59], Cryptococcus nerformans[60]においてもα-1,3-グルカンと病原性に関する報告が相次いだ。その後、2004年になってRappleyeらによってH. capsulatumにおいてα-1,3-グルカンが直接的に病原性発現に寄与することが示された[61]。さらに、H. capsulatumにおいてはα-1,3-グルカンが細胞壁表層に存在し、宿主のβ-グルカン受容体による免疫認識を妨げるために病原性が発揮されることが明らかになった[62]。ゲノム解析以後になると、いくつもの真菌種でα-1,3-グルカン合成酵素遺伝子がアノテーションされ、特にA. fumigatusにおいてα-1,3-グルカン合成酵素遺伝子の詳細な機能解析がなされた[63-66]。A. fumigatusにおいては三種のα-1,3-グルカン合成酵素遺伝子を破壊すると細胞壁からα-1,3-グルカンが欠損し(Δags)[65]、Δags株はマウス感染モデルにおいて顕著に病原性が低減することが報告されている[66]。また、C. neoformansのα-1,3-グルカンは莢膜の主要構成成分であり、α-1,3-グルカン欠損時には病原性が欠失することが報告された[67, 68]。イネいもち病菌Pyricularia oryzae(Magnaporthe grisea)においては、感染器官である侵入菌糸の形成時にその細胞表層をα-1,3-グルカンで覆うことにより、宿主から分泌される細胞壁溶解酵素への耐性が付与され、病原性関連分子パターンの放出が阻止されて、宿主への感染成立に寄与することが示されている[69, 70]。一方、近年になってα-1,3 -グルカン自身は樹状細胞を刺激することが明らかになってきており[71]、菌糸中に存在している場合にα-1, 3-グルカンが免疫ステルス性を示すこととの関係性の解明が望まれている。

 α-1, 3-グルカンの生合成機構については、分裂酵母における化学構造の解析から先行して予想されてきた。1998年に順遺伝学的解析からS. pombeにおいてα-1,3-グルカン合成酵素Ags1pが同定され、Ags1pが細胞内ドメイン、細胞外ドメインおよび多重膜貫通ドメインからなることが推定された[72]。その後同菌のAgs1p(Mok1p)が細胞膜画分に発現していることが確認された[73]。GrünらによってS. pombeのα-グルカンの化学構造が詳細に解析され、S. pombeのα-グルカンは分子量が42.6±5.2kDaで、α-グルカンの約9割がα-1, 3-結合のグルコース、約1割がα-1, 4結合のグルコースであることが明らかになった[74]。また、α-グルカンは約120残基からなる二本のα-1, 3-グルカンが1, 4-結合のα-グルカンによって連結され、さらに糖鎖の還元末端側にもα-1,4-グルカンがあるという構造を有していた[74]。Aspergillus属菌においては、Aspergillus wentiiにおける化学構造の報告がある。A. wentiiのアルカリ可溶(水不溶)グルカンは200残基程度の1, 3-linkedα-グルカンが数残基の1, 4-linked α-glucan(spacer structure)に連結された構造が25回程度繰り返された構造を有すると示唆されており、その分子量は平均850kDaであった[75]。すなわち、Aspergillus属糸状菌のα-1, 3-グルカンはS. pombeに比べて分子量が大きく、サブユニットの繰り返し数が多い構造を取っていることが示唆されている。

 α-1, 3-グルカン合成酵素の3ドメインの機能はS. pombeにおいて推定されている[74]。細胞内ドメインは糖質加水分解酵素(GH)13ファミリーに属するタンパク質(グリコゲンシンターゼ、スターチシンターゼ)と相同なドメインを有しており、UDP-グルコースを基質としてα-1,3-グルカン鎖の伸長を担うと推察されるが、直接的には証明されていない。S. pombeにおける細胞内ドメインのアミノ酸変異体において、α-1,4-グルカンの蓄積が見られなくなったことから[76]、このドメインはα-1,4-グルカンの合成能を有する可能性も示唆されている。細胞外ドメインは、GH13ファミリーに属する細菌のα-アミラーゼとの相同性がある。S. pombeの細胞外ドメインのアミノ酸置換変異体においてα-1,3-グルカン鎖同士の連結を有さない未成熟の短いα-グルカンが合成されたことから[74]、細胞外ドメインは細胞外に排出されたα-1,3-グルカン鎖の糖転移能を有すると考えられている。多重膜貫通ドメインは12回膜貫通がポアを形成すると想定されており、細胞内ドメインで合成された糖鎖の細胞外への輸送を担うと考えられる。Aspergillus属菌のα-1, 3-グルカン合成酵素においても同様のドメイン構造が保存されている。

 Aspergillus section Fumigati以外のAspergilliにおいては、agsB遺伝子(またはそのオルソログ)に隣接してα-amylaseをコードする2遺伝子が存在する;GPIアンカー型α-アミラーゼ遺伝子と細胞内α-アミラーゼ遺伝子である。細胞内α-アミラーゼについては、H. capsulatumのAmy1が先行して研究がなされ、α-1, 3-グルカン合成に必須であることが示された[77]。P. brasiliensis由来AmyAも類似の機能を有すると推察されている[78]。α-1,3-グルカン生合成における作用機構としては、α-1,3-グルカン鎖中に含まれるα-1,4-プライマー(スペーサー)の合成を担うことが推察されているものの、直接的な証明はなされていない。細胞内α-アミラーゼについてはA. niger AmyD(A. nidulans amyGのオルソログによりコードされるタンパク質)においてその酵素学的特性が報告されており、アミロースを基質として主にマルトトリオースが生成されることが分かっているが[79]、グリコゲンやUDP-グルコースに対してはほとんど活性を示さなかったことから、生体内における基質については定かではない。GPIアンカー型α-アミラーゼについては、A. nidulansのamyD遺伝子がα-1, 3-グルカン生合成に抑制的な機能を有することが示されている[80, 81]。HeらはA. nidulans AmyDがα-1, 3-グルカナーゼとは異なる機序でα-1, 3-グルカン量を減少させることを示唆している[81]。また、A. nigerのGPIアンカー型α-アミラーゼAgtAは酵素学的解析がなされており、maltooligosaccharidesをacceptorとして最大28糖のmaltooligosaccharideを転移する糖転移活性を有することが報告されている[82]。また、α-1, 3-グルカン生合成に関わるその他の因子として、H. capsulatumにおいてUTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase(UDPGP)をコードするUGP1遺伝子をRNAiにより抑制したところ、α-1, 3-グルカンが欠損した[77]。UDPGPはグルコース1リン酸をUDP-グルコースに変換する酵素で、真菌種に高度に保存されている。UGP1の抑制によりα-1, 3-グルカンが欠損したことから、α-1, 3-グルカン生合成の基質がUDP-グルコースであることが示唆されている。

 当研究室では、真菌のシグナル伝達経路を標的とした抗真菌剤の開発を進めてきた[83, 84]。Cell wall integrity(CWI)シグナル伝達経路はMAPKカスケードを中心としたシグナル伝達経路で、真菌類に独特で潜在的な薬剤標的となりうると考えられた。我々は、出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeにおいてCWI経路により制御される遺伝子が細胞壁多糖であるβ-1, 3-グルカンやキチンの合成関連遺伝子であるのに対し[85]、モデル糸状菌A. nidulansにおいては本経路が出芽酵母には存在しないα-1, 3-グルカン合成酵素遺伝子の制御に特化していることを明らかにした[86]。上述のように、α-1, 3-グルカンの感染性への寄与が先行して研究されてきたが、非病原性の真菌におけるα-1,3-グルカンの生物学的機能については全く明らかになっていなかった。近年になってFontaineらはα-1, 3-グルカンが発芽分生子の凝集に寄与することを明らかにし、α-1, 3-グルカンがaggregation factorとして機能することを示した[87]。当研究室では、A. nidulansの二種のα-1, 3-グルカン合成酵素遺伝子の破壊株を作製し、agsB遺伝子の破壊によって菌糸が分散する形態を示すことを発見した(Fig.0-2)[12]。また、agsB遺伝子破壊株の細胞壁からα-1, 3-グルカンが欠損していた[12]。すなわち、A. nidulansにおいてはα-1, 3-グルカンが液体振盪培養において主要な菌糸凝集因子であることが示唆された。当研究室での報告の翌年、カナダ・サスカチュワン大学のKaminskyj博士らのグループによっても同様の報告がなされている[80]。A. nidulansのα-1, 3-グルカン欠損株は寒天平板におけるradial growthは野生株と遜色なく[12]、液体振盪培養においては野生株よりも菌糸重量が増加していた[88]。また、A. nidulansのα-1, 3-グルカン欠損株はペニシリンやα-アミラーゼの生産量が野生株に比べて顕著に増加することが示されている(平成26年度一杉修士論文)。このことから、α-1, 3-グルカン欠損株の培養性状は糸状菌を用いた物質生産に応用できる可能性が示唆された。

 以上のように、α-1, 3-グルカンが糸状菌の菌糸接着に寄与することが明らかになってきたものの、α-1,3-グルカンの生合成機構については断片的な情報があるのみで、α-1, 3-グルカンを介した菌糸の塊形成メカニズムについてはほとんど明らかになっていなかった。菌糸の塊形成についてさらに理解するためにはα-1, 3-グルカンの化学構造や生合成機構を含めた解析が必要であると考えられる。本博士論文研究では、α-1, 3-グルカンを介した菌糸凝集のメカニズムについて、その生合成機構も含めて解析することを目的とした(第1章)。また、α-1,3-グルカン欠損株の形質の産業応用に向けて作製された麹菌Aspergillus oryzaeのα-1, 3-グルカン欠損株においては菌糸が完全分散には至らなかったことから(Fig.0-3)、A. oryzaeにおけるα-1, 3-グルカン以外の未知因子の菌糸塊形成への寄与が予想された。そこで本研究では、麹菌で機能する未知因子の同定と、その因子を介した塊形成メカニズムを明らかにすることを目的とした(第2章)。

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